Napretkom dijagnostičkih mogućnosti u mikrobiologiji i zahvaljujući upotrebi najmodernijih molekularnih metoda pogodni uzorci za mikrobiološku dijagnostiku u muškaraca kod kojih je potrebna mikrobiološka analizu su:

1. U slučaju kroničnog prostatitisa pogodni uzorci za mikrobiološku dijagnostiku su srednji mlaz mokraće prikupljen prije masaže prostate i uzorak prvog mlaza mokraće odmah nakon masaže prostate (test tzv. ,,dvije čaše”),
2. U slučaju nadražaja mokraćne cijevi (uretre) pogodan uzorak je prvi mlaz urina (10-20ml) prikupljen nakon što pacijent nije mokrio 2- 4 sata, a u sludaju nadražaja otvora mokraćne cijevi i okolne kože i obrisak,
3. U slučaju kad je potrebna obrada neplodnosti pogodan uzorak je prvi mlaz mokraće OBAVIJEST